| 1 | Doğada yaşayan mikroorganizmalara genel bakış | [1], [2], [3] |
| 2 | Ekolojik kavramlar ve tanımlar, kullanılan metodlara genel bakış (zenginleştirme ve izolasyon) | [1], [2], [3] |
| 3 | Mikroorganizmaları tanımlama ve sayım metodları (canlı sayım, nükleik asit problar, Floresan antikor tekniği vs.) | [1], [2], [3], [4], |
| 4 | Mikrobiyal Aktivite ölçümleri (Radyoizotoplar ve Mikroelektrodlar) | [1], [2], [3] |
| 5 | Aquatik habitatlar ve mikroorganizmalara etki eden faktörler | [1], [2], [3] |
| 6 | Karasal habitatlar ve mikroorganizmalara etki eden faktörler | [1], [2], [3] |
| 7 | Derin deniz mikrobiyolojisi ve mikroorganizmalara etki eden faktörler | [1], [2], [3] |
| 8 | Doğada karbon döngüsü ve mikroorganizmalar, metanojenesis ve sintrofi | [1], [2], [3] |
| 9 | Rumen mikrobiyel ekosistemi, etkili faktörler | [1], [2], [3] |
| 10 | Biyojeokimyasal döngüler (azot) | [1], [2], [3] |
| 11 | Biyojeokimyasal döngüler (Kükürt) | [1], [2], [3] |
| 12 | Biyojeokimyasal döngüler (demir, civa ve iz elementler) | [1], [2], [3] |
| 13 | Petrol ve türevi bileşiklerin doğada biyadegredasyonu, | [1], [2], [3] |
| 14 | Bitki-Mikroorganizma ilşkileri | [1], [2], [3] |